一、RNA干擾實驗定義與核心機制
RNA干擾（RNA interference, RNAi）是一種由雙鏈RNA（dsRNA）介導的轉錄后基因沉默現象，通過特異性降解目標mRNA實現基因表達調控。其核心機制分為以下步驟：
dsRNA切割
Dicer酶將長dsRNA或前體miRNA切割為21-23nt的小干擾RNA（siRNA），每條siRNA 3'端有2-3個突出堿基。RISC復合物形成
siRNA雙鏈解旋后，反義鏈（引導鏈）與Argonaute蛋白結合形成RNA誘導沉默復合物（RISC）。靶標識別與降解
RISC通過堿基配對定位同源mRNA，在距離siRNA 3'端12個堿基處切割mRNA，導致其降解。
二、RNAi類型對比
| 特征 | siRNA | miRNA |
|---|---|---|
| 來源 | 外源dsRNA（病毒、人工合成） | 內源pri-mRNA加工 |
| 長度 | 21-23bp | 21-25nt |
| 互補性 | wan全互補 | 不wan全互補（3'UTR結合） |
| 作用機制 | 切割mRNA | 抑制翻譯或降解mRNA |
| 穩定性 | 低（易降解） | 高 |
| 脫靶率 | 較高 | 較低 |
| 導入方式 | 化學合成、轉染 | 表達載體、病毒導入 |
三、RNA干擾實驗核心應用領域
1. 基因功能研究
高通量篩選：利用RNAi文庫系統性沉默基因，解析基因網絡。
信號通路解析：通過抑制特定基因觀察下游效應，如MAPK通路研究。
2. 疾病治療
癌癥治療：靶向KRAS、BRAF等癌基因，抑制腫瘤增殖（臨床試驗階段）。
抗病毒療法：抑制HBV、HCV病毒基因表達（如丙型肝炎病毒核心蛋白抑制研究）。
3. 農業應用
抗病蟲害作物：通過沉默害蟲關鍵基因（如Bt棉）提高抗性。
性狀改良：調控植物激素合成基因，延長果實保鮮期。
4. 藥物開發
靶點驗證：快速驗證新藥靶標有效性，如阿爾茨海默病相關基因篩選。
RNA藥物：Onpattro（siRNA藥物）獲批治療轉甲狀腺素蛋白淀粉樣變性
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